El CIA de Migjorn, tiene un dispositivo de bioprotección general muy efectivo (doble vallado, descarga de pienso desde el exterior, foso externo al recinto, etc.), por el que se restringe al máximo las entradas al centro. Este hecho se lleva a cabo, única y exclusivamente a través del paso obligado por la ducha de todo el personal que acceda a las instalaciones. De la misma manera, se ha diseñado una entrada única por los animales a través de un muelle de carga situado en la periferia de la valla, que es desinfectado tras cada uso.

El habitáculo destinado a los verracos está formado por pequeñas naves individuales, con capacidades que van desde 4 a 30 machos reproductores, con el fin de conseguir ambientes independientes, aislados entre sí, para evitar el tránsito de posibles patologías infecciosas en el centro. Los verracos se encuentran ubicados en corralinas de 6m2 especialmente diseñadas para machos reproductores, donde se han probado diferentes tipos de tierra y así determinar las mejores condiciones para acoger a los verracos de la raza Pietrain.